La Universidad Federal de São João del-Rei - UFSJ se creo a partir de las tres instituciones de educación superior existentes en Sao Joao del-Rei, en la década de 1980: Don Bosco, Facultad de Filosofía, Ciencias y Letras, Facultad de Ciencias Económicas, Administrativas y Contables y Facultad de Ingeniería Industrial. En un contexto de rescate histórico, nació la Fundación de Educación Superior de São João del-Rei - FUNREI, tras la firma de la Ley N º 7555 del 18 de diciembre de 1986 por el entonces Presidente José Sarney. Finalmente, el 19 de abril de 2002, la institución se transforma en la Universidad Federal, según la Ley 10.425.

La UFSJ cuenta con tres campus en Sao Joao del-Rei: San Antonio, Don Bosco y Tancredo Neves, además de un Centro Cultural “Solar da Baronesa ". En São João del-Rei se ofrecen las siguientes Carreras: Administración, Arquitectura y Urbanismo, Artes aplicadas (Cerámica,) Ciencias Biológicas, Biosistemas, Ciência Animal, Ciencias Contables, Computación, Comunicación Social (Periodismo), Economía, Educación Física, Filosofía, Física, Gografia, Historia, Ingeniería de Produción, Ingeniería Eléctrica, Ingeniería Industrial Mecánica, Lengua y Literatura (Portugués y Inglés), Matemáticas, Música, Pedagogía, Psicología y Química.

La Universidad Federal de São João del-Rei ofrece en el nivel de Postgrado “Stricto Sensu” los programas de Magíster en Bioingeniería, Ciencias de la Salud, Física y Química de Materiales, Historia, Ingeniería de Energía, Ingeniería Eléctrica, Ingeniería Mecánica,  Matemática, Procesos Socioeducativos y Prácticas Escolares, Psicología y Teoría de la Literatura y Crítica de la Cultura.  Desde 1997, la UFSJ ha estado ofreciendo cursos de Postgrado Lato Sensu (Especialización) en Administración y  Matemáticas.

Un cuarto Campus fue implementado para cumplir con el proyecto de expansión del gobierno federal, situado en Alto do Paraopeba en la Ciudad de Ouro Branco y tiene Cinco Carreras de Pregrado en el área de Ingeniería: Ingeniería Civil, Ingeniería Civil de Procesos, Ingeniería Mecatrónica, Ingeniería en Telecomunicaciones e Ingeniería Química. Un quinto Campus fue construido en la ciudad de Divinópolis con cuatro nuevas Carreras en el Área de la Salud: Medicina, Farmacia, Enfermería y Bioquímica. El más reciente campus está ubicado en la ciudad de Sete Lagoas, donde se enseñan Agronomía y Ingeniería de Alimentos.

Para el desarrollo de la enseñanza, investigación y extensión, UFSJ cuenta desde 2010 con una planta constituida de 588 eficientes docentes y 416 administrativos. Más profesores y administrativos están siendo contratados para trabajar en los nuevos Campus de Divinopolis, Alto Paraopeba y Sete Lagoas.

El alto nivel de capacitación del personal profesional y la mayoritaria disponibilidad de cursos por la noche  hacen de la UFSJ una institución pública de calidad excepcionalmente alta e incluyente, con alrededor del 70% de sus estudiantes de pregrado provenientes de escuelas públicas de enseñanza media.